壮医认为内脏气血骨肉，构成人体的主要物质基础。位于颅内和胸腔、腹腔内相对独立的实体都称之为脏腑，没有很明确的“脏”和“腑”的区分观念。颅内容物壮语称为“坞”，含有统筹、思考和主宰梢神活动的意思。如精神病出现精神症状，壮医统称为“玛乱”或“坞乱”、即总指挥部功能紊乱的意思。壮语称心脏为“咪心头”，有脏腑之首的意思。称肺为“咪体”、肝为“咪叠”，胆为“咪背、肾为“咪头”，胰为“咪曼”，脾为“咪隆”（意译为被遗忘的器官），胃为“味胴”、肠为“咪虽”，膀胱为“咪小肚”，妇女胞宫为“咪花肠”、这些内脏各有自己的功能，共同维持人体的正常生理状态，没有什么表里之分。当内脏实体受损伤或由于其他原因引起功能失调时，就会引起疾病。由于壮医没有五行配五脏的理论，因此认为脏腑疾病也没有什么必然的生克传变模式。
壮医三气同步理论主要是通过人体内的谷道、水道和气道及其相关的枢纽脏腑的制化协调作用来实现的。壮族是我国最早种植水稻的民族之一，知道五谷禀天地之气以生长，赖天地之气以收藏，得天地之气以滋养人体。其进入人体得以消化吸收之通道称之为“谷道”（壮语称为“条根埃”），主要是指食道和胃肠。其化生的枢纽脏腑在肝胆胰。水为生命之源，人体有水道进水出水，与大自然发生最直接、最密切的联系。水道与谷道同源而分流，在吸取水谷精微营养物质后，谷道排出粪便，水道主要排出汗、尿。水道的调节枢纽为肾与膀胱。气道是人体与大自然之气相互交换的道，进出于口鼻，其交换枢纽脏腑为肺。三道畅通，调节有度，人体之气就能与天地之气保持同步协调平衡，即健康状态。三道阻塞或调节失度，则三气不能同步而疾病丛生。
壮医认为人体的生殖繁殖机能，也是由天地阴阳之气交感而形成的。男精为阳精，女精为阴精。男精产生于“咪麻”，女精产生于“花肠”。人体顺应着生长壮老死的自然规律，到一定年龄就会具有产生繁衍后代的“精”的能力。两精相搏，形成胚胎，然后在胞宫内发育成人。人生易老天难老，但天地授予人以繁衍后代的能力，故人类能与天地并存并保持“三气同步”。
壮医将人的精神活动，语言及思考能力，归结为“巧坞”的功能。故凡是精神方面的疾病，在治疗上都要着眼于调整“巧坞”的机能。“巧坞”为上部天，位高权重，全身骨肉气血，内脏器官都要接受“巧坞”的指挥，是名副其实的人体总指挥部。“巧坞乱”或“巧坞坏”就会指挥失灵、失误而导致其他脏腑功能失调，使三气不能同步而引发全身性的疾病甚至死亡。
