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其他细菌及病毒感染可引起百日咳综合征。副百日咳杆菌及腺病毒、呼吸道合胞病毒等均可引起类似百日咳的痉挛性咳嗽，主要依靠病原体分离或血清学检查进行鉴别。
小儿顿咳的实验室检查
1、血象：初咳期及痉咳期白细胞总数可高达（20—40）×10的9次方除以L，淋巴细胞占0．6—0．7。
2、细菌培养：鼻咽拭子培养法和咳碟法作细菌培养，有百日咳嗜血杆菌生长。
3、血清学检查：用酶联免疫吸附试验检查血清中特异性lgM抗体，可用于早期诊断。
