一、采收
春播在当年霜降前后，秋播在第2年6～8月间，叶片呈枯萎时采收。采收选择晴天进行，采挖时刨出全根，抖去泥土，除去茎叶，运回加工。
二、留种
1、原地留种收获时，选留部分植株，待第2年即可抽薹开花结籽，以便采种。
2、选株留种收获时，选主根无分叉，粗如拇指且健壮、无病虫害植株的根作种根，按行株距40×80cm栽植，翌年种子成熟后，采收花序中部的种子留种。
三、加工
1、直接晒干
晴天，剪去残存叶基，抹去须根，按大、中、小分级，分别曝晒。
2、硫磺熏蒸
收后遇雨，去泥后应立即熏蒸；晒软后如遇雨或雨淋应立即蒸熏；大白芷要蒸透后再晒。
熏蒸采用烘坑进行，先将白芷按大小和不同干湿程度分别装好，用草包或麻袋盖严，每250kg鲜白芷约需3.5～4kg硫磺，熏时要不断加入硫磺，不能熄灭，直至熏透。熏1昼夜后，取样用小刀切开，在切口涂抹碘酒，如果蓝色很快消失，即表明已熏透，可灭火停熏。假如蓝色反应不消失，则需继续熏硫。熏后应及时晒干，包装贮存在通风干燥处。
