祖国医学认为自然界是由各种物质组成的整体，人是自然界的一个组成部分，与自然界密切联系在一起。例如《素问·六节脏气论》说：“天食人以五气，地食人以五味气台而生，津液相成，神乃自生。”说明自然界存在人类赖以生存的条件。人所以能适应、反映自然界的变化，这本身就是信息的反应。
人对于自然的认识，就是对信息的认识。人利用信息养生，《内经》中亦有论述，如《素问·四气调神大论》说：“夫四时阴阳者，万物之根本也，所以圣人春夏养阳，秋冬养阴，以从其根，故与万物沉浮于生长之门。逆其根，则伐其本，坏其真矣。故阴阳四时者，万物之终始也，死生之本也，逆之则灾害生，从之则苛疾不起，是谓得道。道者，圣人行之，愚者佩之。”阴阳是对．自然界相互关联的某些事物和现象对立双方的概括，它既可以代表两个相互对立的事物，也可以代表同一事物内部所存在的相互的两个方面，在这里是代表自然界四季的寒温变化。着人体能够顺从自然界的变化规律，身体就会健康，违反了自然界变化的规律，就要发生疾病。祖国医学的产生亦与自然界的变化规律紧密相关。如《甲乙经》在论述针灸术的产生时说：“黄帝咨访歧伯、伯高、少禽之徒，内考五脏六腑，外综经络血气色候，参之天地，验之人物，本性命，穷神极变，而针道生焉。”是说针刺学说的产生，是考查了体内五脏六腑，综合了体表经络，气血色脉，再和大自然的变化情况结合起来，广泛地求得验证，根据人的生命和自然界的关系，彻底研究它们其中的奥妙和变化规律，于是便产生了针刺学说。如果从人的机体来看，也可以把他作为一个整体。人体由若于脏腑和组织、器官所组成的，它们各自都有不同的功能，这些各自不同的功能又都是整体活动的一个组成部分，它们之间，以五脏为中心，通过经络把人体联系成一个整体。在生理上，脏腑与皮肉筋骨等形体组织，以及口鼻眼二阴等五官七窍存在着有机的联系，它们之间相互配合默契，有条不紊，共同完成人体统一的机能活动。在发病时，脏腑功能失常，可以通过经络反应于体表、组织、器官，体表、组织、器官发生病变时，同样可以通过经络影响脏腑。如《灵枢·师传篇》说：“身形肢节者，脏腑之盖也。”又说：“五脏之气阅于面。”这些都是从整体观看问题的例证。由于人体各个组织器官共处在于一个统一体中，因此无论在生理上，还是在病理上都是互相联系、互相影响的。祖国医学还指出精神活动与生理活动的密切联系，如《素问·阴阳应象大论》说：“人有五脏化五气，以生喜怒悲忧恐，怒伤肝，喜伤心，思伤脾，忧伤肺，恐伤肾。”所有这些都可以视为体内信息系统反映的特征。不但这些，举凡人体内外环境所有涉及人体的各种各样的刺激，都会形成信息，在对信息的各种适应和反应中，亦反映出信息的意义。
贝塔朗菲在研究生物机体的运动时，发现一切生物体都是在有限的时空中，呈现出复杂有层次的结构，都有各要素（部分）组成的有机整体，做为生物的有机体的组成部分的功能，离开整体，便不复存在。而且生物体与环境有着密切的联系。他发现不仅生物体如此，其他有机体都是如此。因此要解释复杂的生命现象，如组织、结构、遗传、部分与整体的关系等等，及他们之间的联系，都不可缺少重要的因素——信息，信息是反映它们之间联系的重要特征。贝塔朗菲氏现代研究的成果，恰是产生于2000多年以前，祖国医学第一部经典著作《黄帝内经》的精髓。
《黄帝内经》并认为，自然界的一切事物都不是一成不变的，各个事物之间，互相依存，互相制约，以保持相对的对立统一平衡，祖国医学把这种观点用阴阳五行学说加以概括。如《素问·生气通天论》说：“阴平阳秘，精持乃治；阴阳离决，精气乃绝。”信息论同样认为生命的机体是由许多相互联系，相互作用的各部分（要素）组成的复杂体，在正常的情况下，有机体的任何一部、局部又可以看作一个独立的系统；有机体中的任何一个局部系统，可以看作个“子”系统，它亦是以一定的组织性（有序性），多样性（复杂性）处于一定的稳定状态，并通过各个子系统之间的互相联系，相互作用，实现生命过程的调节，保持机体的稳定状态。一旦有祖体出现病态，那么一定是机体中某一“子”系统偏离了稳定的状态，表明它的有序性、组织性、复杂性与多样性发生了某种程度的变化，运用信息的方法，就可以对机体的这种有序性、组织性、复杂性与多样性进行定量的数学描述，就可以判断机体中这些子系统的稳定程度，可以判断这些系统的变化趋势，是巩而激活、还是瓦解衰落。
祖国医学所讲的机体中阴阳对立统一，五行生克制化规律，看来就是信息论所讲的，即它们之间具有取得、保持和传递信息的方法，正因为如此，才使身体得到调节控制，保持正常的生命。祖国医学的整体观，贯穿着整个医疗体系。二千多年以后的今天，祖国医学终于找到了自己的知啻。信息论为祖国医学的理论做了最好的注解。耗散结构创始人普里戈金说：“中国传统的学术思想，是着重于研究整体性和自发性，研究协调和协同，现代科学的发展，更符合中国的这一思想。”普里戈金氏确实是我国学术思想的精通者，他所说的“现代科学的发展，更符合中国的这一思想”（学术思想，当然包括祖国医学的学术思想），确是公允的评价。
还应特别指出的是，祖国医学还具有辩证唯物主义的思想，马克思、恩格斯认为：“一切事物、过程；乃至整个世界，都是由无数互相联系、互相依赖、互相制约、互相作用的事物和过程所形成的统-整体。”恩格斯进一步持出：“宇宙是一个体系，是各种物体相互联系的总体。”斯大林辩证地把自然界“看作有联系的统一的整体，其中各个对象或现象互相有机地联系着，互相依赖着，互相制约着”。由此可见祖国医学在某些方向，确实具有辩证唯物主义的思想。
综上所述，祖国医学的整体观、辩证唯物主义观正是信息论的基础，没有分析，就没有综合，信息论为祖国医学提供了新的理论方法。
