人体健康以真气正常运行为本，一切疾病皆因真气不足或运行不畅所致，若使真气充足调顺，诸病皆愈。所以，真气运行针刺法以真气运行的自然规律为根据，以补益真气和通畅经络为目的，以针刺手法为手段，达到补虚泻实、疏通经络的效果。
真气所受于天，吸入的氧气和摄入的谷气在机体内化生成真气（能量），激活人体经络，而脏腑经络的真气状态始终随昼夜四时等时间节律波动。
迎随补泻法
经络的真气走向是有规律的，手三阴经真气从胸腹走向手，手三阳经真气走向从手走向头，足三阳经从头走向足，足三阴经走向从足走向腹。经络畅通，真气畅行，人即健康，所以一切虚证的治疗措施都是要“顺经络真气走向”针刺，并且留针时间要长，一切实证的治疗措施都是要“逆经络真气走向”针刺，并且留针时间要短，这样才能起到补虚泻实的效果。有歌诀如下：
三阴三阳气血分，凝滞全凭用金针，
左指点穴知真所，右手持针需静心，
补要久留虚不虚，泻要去疾实不侵，
迎气之来夺出窍，随气之去培本真。
呼吸补泻法
呼吸补泻是指进针、出针时配合病人呼吸进行补泻的方法，是针刺基本手法之一。
《素问·离合真邪论》：“吸则内针，无令气忤，静以久留，无令邪布，吸则转针，以得气为故，候呼引针，呼尽乃去，大气皆出，故命曰泻。”“呼尽内针，静以久留，以气至为故，如待所贵，不知日暮，其气以至，适而自护，候吸引针，气不得出，各在其处，推合其门，令神气存，大气留止，故命曰补。”
人们吸气时全身体表组织像胸腔扩张一样也是向外膨胀的，只是幅度较小，不易被察觉罢了。顺应经络组织的这种变化趋势即为补法，即针气相顺为补；逆反经络组织的这种变化趋势即为泻法，即针气相逆为泻。根据这一原则，在患者吸气时进针、吸气时捻针以求得气、呼气时出针均为泻法，呼气时进针、吸气时出针并按压针孔即为补法。
闭穴补泻法
闭穴补泻手法是指起针时对针孔采取的手法，不同的手法可以取得不同的补泻效果。速取针慢闭穴的手法是泻法，可用于实证患者，慢起针速闭穴的手法是补法，可用于体质虚弱的患者。
左手通经手法
右手持针进针后行雀啄式提插捻转的同时，如在手足三阴经，左手向心性按摩相应经络；如在手足三阳经，左手离心性按摩相应经络，通过“以意通经广按摩”的方法，保持经络真气运行的畅通。
