一、种球采挖 当秋季气温开始下降，地上部茎已开始枯死，母球发育到一定程度，则选择晴天挖取种球。采挖前一定要把地上部已枯死的茎拔取集中烧毁，以减少病原。同时注意采挖时不要损伤鳞片，或去除损伤的鳞片，以减小腐烂。
二、种球贮藏前的处理 种球在贮藏之前须进行分级、清洗、消毒、包装等处理。
1、分级 一般地说，百合种球大，则开花数多，种球小则开花数少。因此，种球的分级有利于分别栽植树，便于管理。采挖后，要把大小种球分开，分级的标准是母球为一组，子球为一组。同时注意以下几方面：
若发现鳞片变烂，应及时清除。种球周长在12厘米左右的，可用于切花栽培。已经发芽或长新根的小种球可立即栽培，切忌损伤新根及新芽。对已长新根的大种球，应归为一组，这组种球不能在-2℃温度下低温处理。
2、清洗 已挖取的种球视带土的多少而决定是否清洗，带泥土多者可进行清洗，对于砂质壤土中栽植的种球在晴天采挖的，可不必清洗。除去多的泥土，有利于贮藏前的消毒处理，又有利于消除土壤中的病虫。
3、消毒 为防治病毒病、腐烂病及叶斑病等，要对种球进行消毒处理。消毒处理一般进行1-2次，第一次在种球进冷库前进行，第二次在种球出冷库后，种植前进行。如果是长期贮藏，即指8-12个月，则需进行上述二次消毒处理；如果是短期，即8个月以内，也可只进行上述的第一次消毒处理即可。
4、包装 进行贮藏之前要加以包装，以便于贮藏时期的管理。包装物是经严格清洗消毒后的塑料薄膜。塑料薄膜须打孔14-18个，以便通气。另外，还须使用其有一定含水量的填充物，可选用湿锯木屑或苔藓，注意填充物也须严格消毒，其含水量以手捏不出水来为准。包装方法是，先把塑料薄膜放入箱内，然后在箱底放一层填充物，其厚度为5厘米，在填充物上放一层种球，注意同层种球之间必须由填充物相隔开，如此一层填充物一层种球，放满箱后，将塑料薄膜合拢扎紧。
三、种球的贮藏 百合种球采挖后，为实现周年开花，则必须进行低温处理和贮藏。
