甘草贮藏一般为外包麻布的压缩打包件，每件50公斤，贮于干燥、通风处，商品安全含水量12%~14%。甘草仓库害虫有咖啡豆象、家茸天牛、四星栗天牛等十多种，充氮气或二氧化碳514小时，成 虫及幼虫可全部死亡，甘草内质无明显变化。
甘草易霉变，若空气湿度过大，甘草表面易发生霉斑或白色和绿色菌丝，可采取以下措施防治：含水量确保14%以下，环境相对湿度控制在80%以下，包装密封良好，采用堆位和账去湿。化学熏蒸用10000：1比例的荜澄茄挥发油密封熏蒸6天，其霉菌含量会大为减少。
甘草的贮藏期限不宜过长，有人对乌拉尔甘草在不同贮存期间进行了研究，发现贮存时间对甘草甙含量变化有直接影响，随存放时间的延长而递减，存放1年的为5.12%，2年的为4.24%，3 年的为3.08%。可见，甘草存放时间愈长，药效成分损失愈大，因此，甘草产品要随收随卖，不要贮存时间过长。
